Theo đó, Quy chế này được áp dụng cho toàn bộ hệ thống khám chữa bệnh của nhà nước từ tuyến xã, phường, thị trấn đến tuyến huyện, thị xã, thành phố, tuyến tỉnh và tuyến Trung ương cho các đối tượng là người thuộc hộ nghèo theo quy định hiện hành của Thủ tướng Chính phủ về chuẩn hộ nghèo; đồng bào dân tộc thiểu số đang sinh sống ở xã, phường, thị trấn thuộc vùng khó khăn được quy định tại Quyết định số 30/2007/QĐ-TTg ngày 05/3/2007 của Thủ tướng Chính phủ; người thuộc diện được hưởng trợ cấp xã hội hàng tháng theo quy định của pháp luật, người đang được nuôi dưỡng tại các cơ  sở bảo trợ xã hội của Nhà nước;  người mắc bệnh ung thư, chạy thận nhân tạo, mổ tim hoặc các bệnh khác gặp khó khăn do chi phí cao mà không đủ khả năng chi trả viện phí.
Quỹ dùng để chi cho các chế độ hỗ trợ một phần chi phí khám chữa bệnh cho các đối tượng:
a) Hỗ trợ tiền ăn cho các đối tượng là người thuộc hộ nghèo theo quy định hiện hành của Thủ tướng Chính phủ về chuẩn hộ nghèo khi điều trị nội trú tại các cơ sở y tế công lập từ Trung tâm y tế tuyến huyện trở lên, với mức 3% lương tối thiểu chung/người bệnh/ngày.
b) Hỗ trợ về tiền đi lại trong khám chữa bệnh, chuyển viện của người bệnh khi điều trị nội trú tại các cơ sở y tế công lập từ tuyến huyện trở lên được giao trách nhiệm cho các đơn vị khám chữa bệnh ban đầu thanh toán trực tiếp với BHXH theo quy định của pháp luật hiện hành. Những trường hợp cấp cứu, tử vong hoặc bệnh quá nặng và người nhà có nguyện vọng đưa về nhà nhưng không được bảo hiểm y tế hỗ trợ. Quỹ sẽ hỗ trợ tiền đi lại từ nhà đến bệnh viện, từ bệnh viện về nhà và chuyển bệnh viện cho cho các đối tượng là người thuộc hộ nghèo theo quy định của Thủ tướng Chính phủ về chuẩn hộ nghèo; đồng bào dân tộc thiểu số đang sinh sống ở xã, phường, thị trấn thuộc vùng khó khăn được quy định tại Quyết định số 30/2007/QĐ-TTg, cụ thể như sau:
- Trường hợp sử dụng phương tiện vận chuyển của cơ sở y tế công lập: Thanh toán chi phí vận chuyển cả chiều đi và về cho cơ sở y tế chuyển người bệnh theo mức bằng 0,2 lít xăng/km khoảng cách vận chuyển thực tế, giá xăng, dầu tại thời điểm sử dụng và chi phí cầu, phà, đường bộ khác (nếu có). Nếu có nhiều hơn một người bệnh được vận chuyển trên một phương tiện thì mức thanh toán chỉ được tính như đối với vận chuyển một người bệnh;
- Trường hợp không sử dụng phương tiện vận chuyển của cơ sở y tế công lập: Thanh toán chi phí vận chuyển một chiều đi cho người bệnh theo mức bằng 0,2 lít xăng/km cho một chiều đi tính theo khoảng cách vận chuyển thực tế và giá xăng, dầu tại thời điểm sử dụng.
c) Hỗ trợ một phần chi phí khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế cho các đối tượng là người thuộc hộ nghèo theo quy định của Thủ tướng Chính phủ về chuẩn hộ nghèo; đồng bào dân tộc thiểu số đang sinh sống ở xã, phường, thị trấn thuộc vùng khó khăn được quy định tại Quyết định số 30/2007/QĐ-TTg và người thuộc diện được hưởng trợ cấp xã hội hàng tháng theo quy định của pháp luật, người đang được nuôi dưỡng tại các cơ sở bảo trợ xã hội của Nhà nước, các đối tượng này phải đồng chi trả từ 100.000 đồng trở lên. Mức hỗ trợ bằng 50% tổng chi phí đồng chi trả sau 100.000 đồng. 
 d) Hỗ trợ một phần chi phí khám, chữa bệnh bảo hiểm y tế cho các đối tượng là người mắc bệnh ung thư, chạy thận nhân tạo, mổ tim hoặc các bệnh khác gặp khó khăn do chi phí cao mà không đủ khả năng chi trả viện phí đối với phần người bệnh phải chi trả cho cơ sở y tế của Nhà nước từ 1.000.000 đồng trở lên cho một đợt khám, chữa bệnh trong trường hợp không có thẻ bảo hiểm y tế; mức hỗ trợ bằng 50% tổng chi phí chi trả sau 1.000.000 đồng. Nếu có thẻ bảo hiểm y tế thì sẽ được hỗ trợ như điểm c nêu trên.
Tổng mức các lần hỗ trợ tối đa không 20.000.000 đồng/người/năm.
Không sử dụng Quỹ khám chữa bệnh cho người nghèo để mua thẻ BHYT cho các đối tượng đã có thẻ BHYT; không chi trả chi phí điều trị và các chế độ hỗ trợ khác cho những người bệnh do: say rượu, tự tử, tai nạn do vi phạm Luật Giao thông; khám chữa bệnh theo yêu cầu hoặc sai tuyến theo quy định.